Los grupos de trabajo de EAPN son una dinámica que viene realizándose desde hace años. Los grupos se conforman atendiendo a las demandas y necesidades de las entidades de EAPN o de un análisis de una realidad concreta. A veces son grupos coyunturales y/específica  como la reflexión que se hizo conjuntamente con REAS y Gizardatz sobre al ley de Servicios Sociales, y otras veces tiene un carácter más estable, como el grupo de Participación.

Para formar un grupo basta con transmitir la demanda a Esta dirección electrónica esta protegida contra spam bots. Necesita activar JavaScript para visualizarla , desde donde se dará seguimiento a la solicitud y se convocará a las entidades para que manifiesten su interés por la temática a abordar.

En Abril de 2009, los grupos de trabajo en funcionamiento son: